TUTORIAL APLIKASI GDIS
GDIS (Graphical Display Interface
for Structures) adalah program visualisasi ilmiah untuk manipulasi,
display, dan analisis molekul terisolasi dan struktur periodik. Hal ini dalam
pengembangan, tapi tetap cukup fungsional. Aplikasi GDIS ini memiliki fitur diantaranya sebagai berikut:
- Dukungan
untuk banyak format file umum (CIF, PDB, XTL, XYZ, dan banyak lagi).
- Job
pengajuan alat untuk paket kimia komputasi: GAMESS, Gulp, ReaxMD, dan
SIESTA.
- Job
analisis dan alat grafik untuk simulasi dinamika.
- Berguna
manipulasi alat, termasuk matriks transformasi dan konstruksi supercell.
- Permukaan
yang kuat dan alat generasi kristal morfologi.
- Pola
difraksi generasi dan merencanakan.
- Animasi
multi-frame file.
- Aneka alat untuk visualisasi (pengukuran, pita, layar polyhedral)
Pada tutorial aplikasi GDIS ini misalnya saja kita akan membuat bentuk molekul sederhana yaitu molekul air. caranya dapat diperhatikan sebagai berikut :
1. Buka aplikasi GDIS, dimana tampilan
awalnya akan seperti berikut :
Klik pada ikon new
model untuk membuat model baru,
Pada kolom model pilih model : editing,
2. Pada bagian label ketik nama atom
yang akan digunakan, kemudian klik pada bagian Addatoms dan
klik pada jendela gambar, maka atom akan muncul. Pada penjelasan kali ini saya
akan membuat molekul air sehingga saya akan membuat dua atom H dan sebuah atom
O.
3. Berikutnya untuk membuat ikatan
antar atom diatas, klik Add bonds dan klik salah satu atom dan
tarik ke atom lainnya dan molekul air pun selesai kita buat…
Pada aplikasi ini disediakan
beberapa jenis tampilan molekul, seperti pada aplikasi kimia lainnya dan untuk
memilih tampilan yang diinginkan dapat kita lihat dengan memilih Display pada
bagian model seperti pada gambar berikut ini.
Klik sesuai dengan keinginan maka secara otomatis bentuk molekul akan
berubah-ubah sesuai pilihan anda.
======================SELAMAT MENCOBA :) ======================
Tidak ada komentar:
Posting Komentar